《火焰纹章》系列的三角克制武器系统包含三个元素：魔法，弓箭和黑暗武器。但在新作《火焰纹章IF》中，系统还加入了全新的元素：剑和魔法克制斧头和弓箭，斧头和弓箭克制长矛和黑暗武器，长矛和黑暗武器克制剑和魔法。
虽然《火焰纹章IF》中没有武器使用限制，但为了平衡，更强力的武器在能力上会有所下降，比如，青铜剑不能使用特殊攻击，但会+10特殊攻击躲避。银剑会增加致命躲避5，但你的能量和技能会在下一回合减2。勇气之剑可以攻击两次，但会同时降低你的防御和魔法防御。使用什么武器来战斗是一个复杂的决定。
另外，有6位新角色公布了出来，分别是女仆Felicia，管家Joker，伟大的管家Gunther，忍者Suzukaze，Saizou和Kagerou。Saizou和Kagerou仅在白王国才会出现作为同伴，另外四位在白王国和黑王国都会出现。所有的角色都是用黑暗武器，可以降低敌人的属性。